Le stationnement à l'aéroport de Pardubice est gratuit et sans problème. Les parkings officiels de l'aéroport sont à la disposition des passagers pendant toute la durée de leur séjour.
Le parking non couvert pour le stationnement de longue durée (plus d'une journée) est situé à environ 100 mètres de l'aérogare, le long de la chaussée.