Le terminal de l'aéroport est petit et bien organisé, mais plutôt désuet et assez encombré lorsque plusieurs avions s'y croisent.
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En raison de sa petite taille, l'orientation de l'aéroport est très simple et les distances à pied entre l'entrée et l'avion ne dépassent pas 100 mètres.
Le contrôle de l'immigration à l'arrivée est généralement efficace et les files d'attente ne durent que 10 à 20 minutes.
Transfert entre les vols
Agadir n'est généralement pas un aéroport de transfert et si vous souhaitez passer d'un vol international à un vol domestique ou d'un vol international à un autre, vous devrez toujours quitter la zone de transit et vous enregistrer à nouveau.
Un transfert intérieur (par exemple Casablanca - Agadir - Dakhla) est possible sans quitter la zone de transit.