L'aéroport de Madère n'utilise qu'un seul petit terminal, qui est clair mais peut être bondé aux heures de pointe. Il est recommandé d'être à l'aéroport au moins 2 heures avant le départ.
Hôtels près de l'aéroport de Funchal
Les comptoirs d'enregistrement et de départ se trouvent au 1er étage, les arrivées au rez-de-chaussée du terminal.
L'aéroport est ouvert 24 heures sur 24.
Un point de contrôle de sécurité commun à tous les vols mène à la zone de transit. Le contrôle des passeports, d'où partent les portes d'embarquement pour les pays non membres de l'espace Schengen, est situé dans la zone de transit.